Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Paxbp1P58501 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms