Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrp1P56183 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms