Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pex2P55098 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms