Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec1P51908 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec1P51908 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms