Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CratP47934 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CratP47934 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CratP47934 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CratP47934 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CratP47934 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CratP47934 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CratP47934 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms