Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab23P35288 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms