Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp4P35123 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms