Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxc5P32043 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc5P32043 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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