Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc11P31313 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms