Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms