Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sstr1P30873 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms