Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Defa2P28309 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms