Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja4P28235 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja4P28235 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja4P28235 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms