Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hoxb1P17919 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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