Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms