Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfb1P04202 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tgfb1P04202 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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