Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NmbrO54799 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms