Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CrxO54751 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CrxO54751 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CrxO54751 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms