Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cited2O35740 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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