Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pold2O35654 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pold2O35654 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms