Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms