Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcshO08795 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms