Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm6408J3QNG1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm6408J3QNG1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Gm6408J3QNG1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm6408J3QNG1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm6408J3QNG1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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