Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
7530416G11RikJ3QJX6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms