Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm5798F7BTS7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5798F7BTS7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5798F7BTS7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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