Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm17728E9Q5K2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17728E9Q5K2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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