Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Hectd4E9Q2E4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms