Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Klhl3E0CZ16 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl3E0CZ16 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms