Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms