Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCRIP1C9JLW8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms