Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cspp1B2RX88 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms