Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud7bB2RUR8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud7bB2RUR8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms