Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf518aB2RRF6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf518aB2RRF6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms