Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSK3

Lnp1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnp1A0A1B0GSK3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lnp1A0A1B0GSK3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lnp1A0A1B0GSK3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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