Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trbv30A0A0B4J1P1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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