Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk1bQ9Z2C6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upk1bQ9Z2C6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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