Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CnmdQ9Z1F6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CnmdQ9Z1F6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms