Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM2AQ9Y2K7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM2AQ9Y2K7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms