Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms