Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pfdn5Q9WU28 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
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Pfdn5Q9WU28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn5Q9WU28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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