Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slit2Q9R1B9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slit2Q9R1B9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms