Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmQ9QXG2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms