Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp1Q9JLK7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp1Q9JLK7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms