Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnga3Q9JJZ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cnga3Q9JJZ8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms