Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms