Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms