Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cmtm7Q9ESD6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms