Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms