Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne8Q9DC53 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms