Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnk1dQ9DC28 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Csnk1dQ9DC28 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Csnk1dQ9DC28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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